磁珠法土壤和糞便基因組
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
本試劑盒采用的脫腐緩沖液系統(tǒng),可以將土壤樣本中的腐植酸盡可能的去除,并且 配有的研磨珠可有效破碎土壤樣本中的各種復(fù)雜成分,保證從土壤中提取基因組DNA的完整 性,同時(shí)本試劑盒也適用于糞便樣本的基因組DNA提取。
使用本試劑盒回收的DNA雜質(zhì)少,完整性好,可直接用于PCR、酶切等分子生物學(xué)下游 實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品特點(diǎn)
適用范圍廣:適用于花壇土、花盆土、農(nóng)田土、山林土、淤泥、紅土、黑土、粉塵等多類土 壤環(huán)境樣本的提取,同樣適用于糞便樣本的提取。 操作便捷:能夠集中在相對(duì)較短時(shí)間內(nèi)完成實(shí)驗(yàn)操作。
高純度:與磁珠法純化相結(jié)合,提取的DNA純度高,可直接用于下游實(shí)驗(yàn)。
注意事項(xiàng) 請(qǐng)務(wù)必在使用本試劑盒之前閱讀此注意事項(xiàng)。
1.新采取的樣本會(huì)得到更高的得率,不同樣本在采樣前應(yīng)先查閱相應(yīng)的保存條件。
2. 在需要吸取上清液的步驟中應(yīng)避免吸到沉淀,否則會(huì)影響產(chǎn)物純度。
3. 緩沖液GFA、去蛋白液RD和漂洗液PWD使用前請(qǐng)參照瓶上標(biāo)簽加入相應(yīng)的醇。
4. 過(guò)量的DNA可能抑制下游PCR反應(yīng),遇到這種情況建議將DNA模板進(jìn)行稀釋后使用。
5. 使用前檢查緩沖液SC是否有沉淀,若有沉淀,請(qǐng)?jiān)?7℃加熱至溶解后使用。
6. 糞便樣本中可能有RNA殘留,如果需要去除RNA,需自備RNase A溶液(目錄號(hào): RT405-02)。
操作步驟
使用前請(qǐng)先在緩沖液GFA中加入異丙醇;在去蛋白液RD和漂洗液PWD中加入無(wú)水乙醇,加 入體積請(qǐng)參照瓶上標(biāo)簽。
1. 樣本處理
1)土壤樣本處理: 在2 ml離心管中加入樣本0.25-0.5 g,加入500 µl緩沖液SA、100 µl緩沖液SC和0.25 g研 磨珠,渦旋振蕩15 min至樣本混勻或使用TGrinder H24組織研磨均質(zhì)儀(OSE-TH-01) 混勻(6M/S的速度振蕩30s,間隔30s,共2個(gè)循環(huán))。12,000 rpm (~13,400×g ) 離心1 min,轉(zhuǎn)移上清液(約500 µl)至新的2 ml離心管。
注意:針對(duì)一些得率低或需提取真菌基因組的樣本,建議渦旋震蕩混勻或組織勻質(zhì)儀震 蕩混勻后70℃加熱裂解15 min以提高裂解效率。 2)糞便樣本處理: 在2 ml離心管中加入樣本0.25-0.5 g,如果是液態(tài)樣本則轉(zhuǎn)移200 µl至離心管中,加入500 µl緩沖液SA、100 µl緩沖液SC和0.25 g研磨珠,(糞便樣本中可能有RNA殘留,如果需 要去除RNA,建議再加入10 µl RNase A(TIANGEN,RT405-02, 自備))渦旋震蕩混 勻或組織勻質(zhì)儀震蕩混勻后70℃加熱裂解15min提高裂解效率。12,000 rpm (~13,400×g ) 離心1 min,轉(zhuǎn)移上清液(約500 µl)至新的2 ml離心管。
注意:對(duì)于較難破壁的革蘭氏陽(yáng)性菌,可將溫度提高至95℃以促進(jìn)裂解。
2. 加入200 µl緩沖液SH混勻,渦旋5 sec,4℃放置10 min。
3. 12,000 rpm (~13,400×g ) 離心3 min,轉(zhuǎn)移上清液至新的2 ml離心管,加入500 µl緩沖液 GFA(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入異丙醇),顛倒混勻。
注意:轉(zhuǎn)移上清時(shí)不要移走沉淀,否則可能降低DNA純度。
4. 加入10 µl磁珠懸浮液G,振蕩混勻5 min。
注意:為了確保磁珠重懸,請(qǐng)?jiān)谑褂们罢袷幓靹?nbsp;
5. 將離心管放置于磁力架上靜置30 sec,磁珠吸附后,小心吸去液體。
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