次氯酸鈉的滅菌殺病毒原理大致有如下三種作用方式：

大家都知道，次氯酸鈉消殺最主要的作用方式是通過(guò)它的水解形成次氯酸，次氯酸再進(jìn)一步分解形成新生態(tài)氧[O]，新生態(tài)氧的*氧化性使菌體和病毒上的蛋白質(zhì)等物質(zhì)變性，從而致死病源微生物。其實(shí)，氯氣消毒的原理也主要是以產(chǎn)生出次氯酸，然后釋放出新生態(tài)氧[O]的方式。

根據(jù)化學(xué)測(cè)定，PPM級(jí)濃度的次氯酸鈉在水里幾乎是*水解成次氯酸，其效率高于99.99%。其過(guò)程可用化學(xué)方程式簡(jiǎn)單表示如下：

NaClO + H₂O ＝ HClO + NaOH

HClO → HCl + [O]

其次，次氯酸在殺菌、殺病毒過(guò)程中，不僅可作用于細(xì)胞壁、病毒外殼，而且因次氯酸分子小，不帶電荷，還可滲透入菌（病毒）體內(nèi)，與菌（病毒）體蛋白、核酸、和酶等有機(jī)高分子發(fā)生氧化反應(yīng)，從而殺死病原微生物。 

         R-NH-R + HClO → R₂NCl + H₂O

同時(shí)，次氯酸產(chǎn)生出的氯離子還能顯著改變細(xì)菌和病毒體的滲透壓，使其細(xì)胞喪失活性而死亡。

此外，次氯酸鈉還能夠分解蔬菜、水果等農(nóng)副產(chǎn)品上所殘存的微量農(nóng)藥。絕大多數(shù)農(nóng)藥都是由有機(jī)物組成的，次氯酸鈉所釋放出來(lái)的新態(tài)氧能氧化分解掉這些物質(zhì)。這無(wú)疑對(duì)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)、果蔬包裝業(yè)的發(fā)展具有重大推動(dòng)作用。

還有值得肯定的是，由于次氯酸鈉發(fā)生器所生產(chǎn)的消毒液中不象氯氣、二氧化氯等消毒劑在水中產(chǎn)生游離氯，所以一般難以形成因存在游離氯而生成不利于人體健康的致癌物質(zhì)；也不象臭氧那樣只要空氣中存在很微弱的量（0.001mg/m³）便會(huì)對(duì)生命造成損傷和毒害；而且，還不會(huì)象氯氣同水反應(yīng)會(huì)最后形成鹽酸那樣，對(duì)金屬管道造成嚴(yán)重腐蝕。