EvaGreen 是一種用于實(shí)時(shí)定量 PCR(qPCR)的DNA結(jié)合染料。它的諸多優(yōu)點(diǎn)使它遠(yuǎn)勝于SYBR Green I。除了有相似的光譜特性,EvaGreen有三個(gè)主要特點(diǎn)使它區(qū)別于SYBR Green I。
EvaGreen對(duì)PCR的抑制性遠(yuǎn)小于SYBR Green I。因此,使用EvaGreen進(jìn)行的qPCR實(shí)驗(yàn)可以使用快速PCR步驟。同時(shí),EvaGreen在實(shí)驗(yàn)中可以使用較高的濃度,從而獲得遠(yuǎn)強(qiáng)于SYBR Green I擴(kuò)增信號(hào)。較高濃度的EvaGreen也消除了“染料重分布"的缺陷,使EvaGreen既可用于多重PCR,也可用于高分辨率(高清晰)熔解曲線分析(HRM)。該分析正被越來(lái)越多的用于PCR后的基因分型和異源雙鏈分析。由于SYBR Green I對(duì)PCR的抑制性,從而要求其使用濃度必須很低,因此 SYBR Green I無(wú)法解決由低濃度造成的染料重分布問(wèn)題,既不能用于多重PCR也不能用于HRM。同時(shí),染料重分布問(wèn)題也可能影響常規(guī)熔解曲線的可靠性,因?yàn)榈腿埸c(diǎn)的DNA鏈可能由于這種原因而無(wú)法檢測(cè)到 。
EvaGreen的穩(wěn)定性*。在正常的儲(chǔ)存、操作和PCR過(guò)程中不會(huì)被破壞。在緩沖溶液中的染料可以安全的儲(chǔ)存在室溫或冰箱里,也可以反復(fù)凍融。與之相反,SYBR Green I不穩(wěn)定而且降解后對(duì)PCR抑制性更強(qiáng) 。
EvaGreen降低了細(xì)胞膜透性,因而比SYBR Green I更加安全。測(cè)試結(jié)果顯示,EvaGreen既沒(méi)有誘變性也沒(méi)有細(xì)胞毒性。相反,雖然 SYBR Green I本身誘變性很弱,但它在細(xì)胞中可能抑制了正常DNA的修復(fù)機(jī)制,使其有誘變?cè)鰪?qiáng)作用。
EvaGreen的特性:
1. *的靈敏度:在推薦濃度下使用時(shí)可以獲得*的PCR擴(kuò)增信號(hào)。
2. PCR 抑制性極?。褐悄芑摹鞍匆筢尫?DNA結(jié)合技術(shù)使得EvaGreen對(duì)PCR的抑制遠(yuǎn)小于SYBR Green I。
3. 和快速PCR兼容:對(duì)PCR干擾極小,從而極大的縮短了PCR延伸時(shí)間。
4. 非常適合HRM分析:無(wú)“染料重分布"缺陷,兼容PCR后的高分辨率熔解曲線(HRM)分析。
5. 兼容多重 PCR:在推薦濃度下使用時(shí),無(wú)擴(kuò)增子之間的染料遷移現(xiàn)象。
6. *穩(wěn)定性:在大部分生化條件下非常穩(wěn)定,可在室溫下儲(chǔ)存并可反復(fù)凍融。
7. 安全性好:細(xì)胞膜穿透性測(cè)試表明,EvaGreen幾乎不能穿透細(xì)胞膜,安全性高。
8. *的兼容性:和SYBR Green I光譜相似,和各的qPCR儀器兼容。用EvaGreen 替代SYBR Green I,無(wú)需改變?nèi)魏文壳笆褂玫牟僮鞑襟E和儀器設(shè)備。