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生物通報道:科學家們將四種核磁共振技術結(jié)合起來,解析了兩個重要蛋白之間的關鍵相互作用。文章于六月二十四日發(fā)表在美國國家*院刊PNAS雜志上。這項研究展示了分子伴侶與無序蛋白的結(jié)合過程,這樣的相互作用廣泛存在于生物界。分子伴侶能與較小的無序蛋白結(jié)合,并幫助它們形成特定的構(gòu)象,這是保證蛋白正確折疊的重要機制。
研究人員對膠囊狀的細菌分子伴侶GroEL,和無序的β-淀粉樣蛋白(A-beta)進行研究,A-beta是阿爾茨海默癥中的核心蛋白。人們對這兩種蛋白都很熟悉,但并不清楚GroEL膠囊是如何開啟并捕獲目標的。
NMR能夠反映蛋白之間的相互作用及其動力學,但單一的NMR往往不能提供全面的信息。為此,美國國立衛(wèi)生研究院NIH的研究人員將四種不同的NMR技術結(jié)合起來,成功解析了A-beta與GroEL結(jié)合時的結(jié)構(gòu)和動態(tài)。這項研究的資深作者是NIH的Marius Clore,*作者Nicolas Fawzi目前是布朗大學分子藥理學的助理教授。
研究人員發(fā)現(xiàn),GroEL只在兩個疏水位點與A-beta結(jié)合,使較小的A-beta蛋白可以在多種構(gòu)象間轉(zhuǎn)變。這兩個蛋白并沒有全程結(jié)合在一起,而是在不斷的解離和重新結(jié)合。事實上,A-beta會時不時地在GroEL的結(jié)合腔中跳躍。“我們利用四種NMR獲得了豐富的信息,包括蛋白結(jié)合時的結(jié)構(gòu)、蛋白解離/重新結(jié)合的頻率,以及蛋白在不同位點的活動,”Fawzi說。“研究顯示,A-beta在結(jié)合時并沒有形成特定的結(jié)構(gòu),而是保持著構(gòu)象的靈活性。”
研究人員指出,GroEL的這種松散方式,使它能夠結(jié)合多種不同的無序蛋白,同時也節(jié)省了能量。如果要在捕獲初期強迫蛋白形成特殊構(gòu)象,就需要更多的能量,而這樣做并不劃算。研究顯示,GroEL在初始結(jié)合后關閉,將目標蛋白*裝入膠囊。此時,分子伴侶才會投入能量,促使蛋白以正確的方式折疊。
對于分子和結(jié)構(gòu)生物學家來說,這種將NMR技術混合使用的方式,可以幫助他們闡明之前難以解析的相互作用。“這種方法可以為人們展示,更多大型蛋白機器的作用機制,不只是GroEL,”Fawzi說。
來源:生物通
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