來自Genetech公司（已被羅氏制藥收購）生物信息學(xué)與計(jì)算機(jī)生物學(xué)部，以及 Complete Genomics公司等處的研究人員通過比對(duì)肺部腫瘤和正常組織中的基因序列，發(fā)現(xiàn)了多個(gè)與肺癌相關(guān)的基因突變，這些癌基因的發(fā)現(xiàn)對(duì)于未來研究肺癌靶向治療，以及基因突變具有重要的意義。這一研究成果公布在《自然》（Nature）雜志上。

　　文章的通訊作者是Genetech公司的張澤民（Zemin Zhang，音譯）博士，其早年畢業(yè)于南開大學(xué)，之后獲得賓夕法尼亞州立大學(xué)博士學(xué)位，主要研究興趣是癌癥基因組學(xué)，其研究組利用計(jì)算機(jī)方法嘗試預(yù)測疾病基因突變。

　　每年由于吸煙導(dǎo)致肺癌的病例數(shù)不勝數(shù)，在工業(yè)發(fā)達(dá)國家如美國等，肺癌的發(fā)病率占常見癌癥的*，為*位癌癥死亡原因。煙草中的致癌物如3，4-苯并芘、煙焦油等的致癌作用是一致*的。

　　2010年1月，英國劍橋大學(xué)韋爾科姆基金會(huì)桑格學(xué)院的研究人員利用大規(guī)模高通量測序技術(shù)，對(duì)小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系：NCI-H209進(jìn)行了測序分析，發(fā)現(xiàn)了與吸煙有關(guān)的突變。他們發(fā)現(xiàn)了22910個(gè)候選因子，其中還包括了134個(gè)編碼外顯子。

　　而的這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)了超過5萬個(gè)基因點(diǎn)突變，其中530個(gè)得到確認(rèn)，它們當(dāng)中392個(gè)在編碼區(qū)域，包括以前已知的變異，如KRAS“原致癌基 因”突變和放大。這些數(shù)據(jù)表明，遺傳上復(fù)雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變，而且要識(shí)別復(fù)發(fā)性致癌“驅(qū)動(dòng)突變”（driver mutation），將需要對(duì)很多尚未測序的樣本進(jìn)行測序。

　　完整基因組測序?yàn)榘ǚ伟┰趦?nèi)的若干種癌癥類型的突變譜提供了線索。在這篇文章中，研究人員從全基因組范圍內(nèi)來觀察突變差異，他們對(duì)一名煙齡超 過15年，平均每天吸煙25根的原發(fā)性肺部腫瘤患者進(jìn)行分析，將這名患者的癌細(xì)胞和相鄰正常組織的完整序列進(jìn)行了比較。發(fā)現(xiàn)了多達(dá)5萬個(gè)基因突變，這一數(shù) 目非常龐大，過去從未有研究發(fā)現(xiàn)如此多的基因突變。

　　研究人員認(rèn)為這可能和患者的煙齡有關(guān)，通過這一患者吸煙的數(shù)量和基因突變的比例來看，籠統(tǒng)來說就是每吸三根煙即可能產(chǎn)生一個(gè)基因突變。當(dāng)然具體 的情況更為復(fù)雜，但是研究人員也指出，雖然人體的DNA修復(fù)機(jī)制能部分修復(fù)由于吸煙帶來的傷害，但是吸煙時(shí)間越長，這種機(jī)制功能就越差。

　　除此之外，研究人員還在這5萬個(gè)基因中找到了392個(gè)在編碼區(qū)域的突變，包括以前已知的變異，如KRAS原致癌基因突變和放大。這些數(shù)據(jù)表明，遺傳上復(fù)雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變。